Úrad inšpekčnej služby na úseku ochrany, prevencie a inšpekcie plní najmä tieto úlohy:
- eviduje a vybavuje oznámenia a podania o podozrení z páchania trestnej činnosti príslušníkov Policajného zboru, príslušníkov Zboru väzenskej a justičnej správy a príslušníkov Finančnej správy (colníkov) podľa osobitných predpisov,
- prijíma trestné oznámenia, a ak je podozrivým príslušník Policajného zboru, príslušník Zboru väzenskej a justičnej správy alebo príslušník Finančnej správy (colník), vybavuje ich podľa Trestného poriadku, v rozsahu ustanovenom osobitným predpisom,
- vykonáva operatívno-pátraciu činnosť podľa osobitného predpisu,využíva informačno-technické prostriedky a databázy informačných systémov ministerstva a Policajného zboru,
- plní úlohy v oblasti informačno-technických prostriedkov podľa interného predpisu, v oblasti sledovania osôb a vecí a cezhraničného sledovania podľa interného predpisu a v oblasti nástrahovej a zabezpečovacej techniky podľa interného predpisu,
- spolupracuje s útvarmi ministerstva, útvarmi Policajného zboru, útvarmi a zariadeniami Zboru väzenskej a justičnej stráže a útvarmi Finančnej správy pri odhaľovaní trestnej činnosti príslušníkov ozbrojených bezpečnostných zborov a colníkov, navrhuje preventívne opatrenia, vyžaduje potrebnú spoluprácu a súčinnosť pri plnení úloh inšpekčnej služby od príslušníkov Policajného zboru, príslušníkov Zboru väzenskej a justičnej stráže, príslušníkov Finančnej správy, príslušníkov Hasičského a záchranného zboru, príslušníkov Horskej záchrannej služby, štátnych zamestnancov a zamestnancov,
- vo vyšetrovaní a v skrátenom vyšetrovaní vo veciach, ktoré vyšetruje, je oprávnený vyžadovať od útvarov ministerstva, útvarov Policajného zboru, Zboru väzenskej a justičnej stráže alebo útvarov Finančnej správy a v súlade so zákonmi a inými všeobecne záväznými právnymi predpismi zabezpečenie vykonania úkonov a opatrení nevyhnutných pre vyšetrovanie, ktoré vzhľadom na ich povahu nemôže vykonať sám.